选择适合潜入任务的忍者需要综合考虑忍者的技能特性、隐蔽能力和战术适应性。在火影忍者系列游戏中，潜入任务通常要求忍者具备高机动性、隐蔽手段以及应对突发情况的能力。部分忍者天生适合这类任务，例如擅长潜行忍术的药师兜、拥有无尘迷塞的二代土影无，以及能利用蛤蟆隐之术的自来也。这些忍者的技能设计使其在潜入时不易被察觉，同时具备脱离危险的能力。
药师兜的潜入能力主要依靠其出色的谍报技巧和伪装能力。他没有依赖特殊忍术，而是通过长期间谍经验掌握隐蔽行动的要领。这种特性使他在需要长期潜伏或收集情报的任务中表现优异。相比之下，二代土影无的能力更为全面，其无尘迷塞可以完全隐藏查克拉波动，配合分裂之术能轻松应对多人围剿。这类忍者在执行高难度潜入时更具优势，尤其是在敌方感知型忍者较多的场景中。
自来也的潜入方式则依赖妙木山的蛤蟆系忍术。蛤蟆隐之术能将他隐藏于深水或结界中，有效避开常规感知手段。蛤蟆平影操控术允许他依附于他人影子进行移动和操控，适合短距离渗透。这类技能对地形有一定要求，若环境不适合则可能暴露行踪。选择自来也时需要提前规划行动路线，确保其技能能发挥最大效果。
对于追求稳定性的玩家，山中井野忍界大战和萨姆伊也是不错的选择。井野的远程炸弹和毒飞镖能干扰敌人行动，创造潜入机会；萨姆伊的雷电圈和瞬移技能则提供快速脱离的手段。这类忍者虽不具备绝对隐蔽性，但通过技能组合能有效降低任务难度。潜入任务的核心在于扬长避短，根据任务目标和个人操作习惯选择最合适的忍者。
