守护神殿模式是元气骑士中一种集探险、挑战、防御于一体的玩法，玩家需要带领骑士团队深入神秘神殿，面对各种怪兽和陷阱的挑战。该模式的核心目标是保护魔法石不被敌人摧毁，同时通过合理布局防御设施、升级角色技能和武器来应对不断增强的敌人攻势。进入该模式需要先通关1-5副本解锁古代传送门，消耗500蓝币即可开启挑战。模式采用无尽波次设计，每十五波为一大关，五波为一小关，波次增加，敌人数量和难度会显著提升。
在角色选择上，牧师因其一技能能为炮台回血的特性成为推荐角色，尤其适合前期节省维修费用。武器方面建议优先制作高伤害武器如天堂之拳或导弹发射器，以应对初期压力。神殿内设有多个功能区域，包括大殿、后殿和怪物据点，其中大殿中央的魔法石是防守核心，后殿则提供炮台购买、技能升级等支援功能。机械大师处可购买不同类型的防御塔，包括护盾塔、能量装置等，需根据敌人特性合理布置。炮台可通过消灭怪物获取经验升级，最高可提升至18级，品质则通过重复购买相同炮台进阶。
资源管理是通关关键，金币和紫币需优先用于武器升级和防御设施建设。武器可通过仓库系统重铸以获取更强属性，而角色等级提升则依赖击败怪物获取经验值。特殊事件如护送水晶或击败烈焰精灵会提供额外奖励，需把握时机完成。多人协作模式下，团队分工能更有效应对高强度波次，例如分配人员负责维修防御塔或清理漏网敌人。敌人类型分为普通小怪、精英怪和BOSS，其中每十五波会出现双BOSS组合，需提前准备爆发型武器应对。
后期阶段需重点关注母舰类BOSS的应对策略，其拥有两个阶段战斗机制，第一阶段需优先摧毁四个配件中的弹幕发射器。战斗中要避免被激光追踪或导弹集中攻击，利用场景安全区域规避范围伤害。角色技能如气宗的冲脉拳或精灵的专注射击在清怪和BOSS战中表现突出，配合暴击穿透、子弹反弹等天赋效果更佳。通关后根据难度可获得不同奖励，包括蓝图碎片和角色解锁道具。该模式对操作技巧和策略规划均有较高要求，需通过反复尝试优化防御布局和资源分配方案。
